Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ifitm1Q9D103 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms