Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Zbed3Q9D0L1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Zbed3Q9D0L1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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