Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc47Q9D024 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc47Q9D024 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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