Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf146Q9CZW6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf146Q9CZW6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms