Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssu72Q9CY97 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssu72Q9CY97 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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