Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrrc17Q9CXD9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lrrc17Q9CXD9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lrrc17Q9CXD9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc17Q9CXD9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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