Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin4Q9CWW6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms