Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tdrd12Q9CWU0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms