Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdca4Q9CWM2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cdca4Q9CWM2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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