Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms