Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nsmce3Q9CPR8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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