Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Krt23Q99PS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms