Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ubqln4Q99NB8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubqln4Q99NB8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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