Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gdpd3Q99LY2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdpd3Q99LY2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms