Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp16Q99LG0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp16Q99LG0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms