Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
EtfaQ99LC5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms