Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SmagpQ99KC7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms