Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tspan1Q99J59 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms