Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc8b1Q925Q3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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