Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb6Q922F4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb6Q922F4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms