Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Med28Q920D3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms