Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ttc1Q91Z38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc1Q91Z38 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms