Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcdhb12Q91Y07 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms