Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms