Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Stx18Q8VDS8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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