Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms