Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf183Q8QZS5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rnf183Q8QZS5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms