Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssh3Q8K330 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssh3Q8K330 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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