Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Brd3Q8K2F0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms