Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd300eQ8K249 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd300eQ8K249 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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