Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim68Q8K243 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Trim68Q8K243 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trim68Q8K243 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim68Q8K243 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim68Q8K243 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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