Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cnppd1Q8K158 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cnppd1Q8K158 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnppd1Q8K158 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cnppd1Q8K158 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnppd1Q8K158 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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