Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc4a8Q8JZR6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc4a8Q8JZR6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc4a8Q8JZR6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc4a8Q8JZR6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Slc4a8Q8JZR6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms