Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Setd1bQ8CFT2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms