Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ercc8Q8CFD5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms