Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc28aQ8CEI3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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