Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp27Q8CEG8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp27Q8CEG8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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