Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc38Q8CDN8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms