Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atad2Q8CDM1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atad2Q8CDM1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms