Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Lrif1Q8CDD9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrif1Q8CDD9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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