Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CD60 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CD60 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CD60 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CD60 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CD60 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CD60 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8CD60 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8CD60 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms