Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacnb2Q8CC27 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cacnb2Q8CC27 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms