Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp20Q8C6M1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp20Q8C6M1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms