Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms