Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Ccdc113Q8C5T8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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