Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim35Q8C006 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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