Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Tnfsfm13Q8BXS2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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