Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup54Q8BTS4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup54Q8BTS4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms