Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Suds3Q8BR65 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms