Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ubash3bQ8BGG7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms